公司仅承担500元社保，员工缴纳1000元是否合法，需依据当地社保政策及具体缴费比例来判断。以下从不同情形为您具体分析：1.若当地社保缴费基数下限较高，且五险综合缴费比例中企业应缴部分超过500元：例如某地养老保险企业承担16%、医疗保险8%、失业保险0.5%、工伤保险0.2%、生育保险0.8%，合计25.5%，若缴费基数为4000元，企业应缴1020元（4000×25.5%），此时公司仅承担500元则不合法。2.若员工工资远高于社保缴费基数上限，企业按上限基数缴费且应缴部分为500元：例如某地社保缴费基数上限为20000元，企业综合缴费比例2.5%（假设为特殊政策），则企业应缴500元（20000×2.5%），此时公司承担500元可能合法，但需符合当地特殊政策。3.若企业未按员工实际工资申报社保基数，导致企业缴费部分被人为压低至500元：例如员工实际工资8000元，企业却按2000元基数（低于当地下限）申报，企业应缴500元（2000×25%），这种情况因基数申报违规而不合法。

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